Acesse o Filezilla e clique no menu Arquivo => Gerenciar site, conforme imagem abaixo:
Abrirá a tela de cadastro de site/conexão, clique em novo site depois adicione um nome à ele e informe os dados de conexão da seguinte forma:
Host: Domínio do site. No exempli esta como: seudominio.com, mas lembre de alterar para o nome do seu site, sem o www.
Porta: 21 ou deixe em branco
Protocolo: FTP – Protocolo de transferência de Arquivos.
Criptografia: “Only use Plain FTP (insecure)” ou “Usar FTP Simples”
Tipo de Logon: Normal
Usuário: informe o usuário ftp. O usuário FTP é igual ao do cPanel.
Senha: informe a senha do usuário FTP/cPanel
Clique em CONECTAR.